En la tarde del 1 de mayo de 2011, el E-6B 164409 partió de la RAF Mildenhall y voló en órbita sobre el Reino Unido durante varias horas. Se especula que el avión era el relevo de un par de Northrop B-2 Spirits que habían sobrevolado el Mediterráneo y continuaban hacia Pakistán. A las 01:00 horas del 2 de mayo, un equipo de los SEAL de la Marina de los EE.UU. se introdujo de forma encubierta mediante helicópteros en un complejo de Abbottabad (Pakistán), donde vivía el líder terrorista Osama bin Laden. El equipo mató a Bin Laden y neutralizó la zona.
La presencia de los B-2 fue como respaldo en caso de que el plan del equipo SEAL fallara. Como la operación Neptune Spear fue un éxito, los B-2 no fueron necesarios y, tras una salida de ocho horas, el E-6B aterrizó de nuevo en Mildenhall, antes de regresar a Estados Unidos dos días después.
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